北京畜牧兽医(yī)研究所猪基因组近交系数评估取得新(xīn)进展

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2020-05-07 14:11:00 来源：中(zhōng)國(guó)农业科(kē)學(xué)院北京畜牧兽医(yī)研究所

近日，牧医(yī)所猪遗传育种创新(xīn)团队在猪基因组近交系数评估上取得新(xīn)进展，為(wèi)猪的育种保种工(gōng)作(zuò)和避免实际育种中(zhōng)的近亲交配提供了参考依据。

　　据介绍，连续纯合片段（runs of homozygosity, ROH）是亲代将同源相同的单倍型传递给子代而形成的，基于ROH计算的基因组近交系数是个體(tǐ)真实的近交系数，它比传统系谱计算的期望近交系数更加准确，而且不再依赖于系谱记录的准确性和完整性，能(néng)准确地反映两个配子间的关系。

　　研究针对2569个大白猪共检查到176182个ROH，其中(zhōng)ROH数目最多(duō)的染色體(tǐ)為(wèi)6号，最少的為(wèi)12号，而覆盖率最高為(wèi)14号，最低的為(wèi)13号。研究进一步发现，检测到的ROH并非均匀分(fēn)布在基因组上，通过ROH计算的平均基因组近交系数為(wèi)0.14，而系谱為(wèi)0.011，两者的相关系数為(wèi)0.35，并在ROH富集的基因组區(qū)段注释到与大白猪繁殖性状、肌肉发育和脂肪沉积相关的基因，如： SIRT1 、 MYPN 、 SETDB1 和 PSMD4 ，為(wèi)鉴定候选基因提供了有(yǒu)效的方法。

　　研究成果已发表在农林科(kē)學(xué)1區(qū)和奶制品与动物(wù)科(kē)學(xué)1區(qū)的《Journal of Animal Science and Biotechnology》上。本文(wén)的第一作(zuò)者為(wèi)史良玉博士研究生和王立刚副研究员，通讯作(zuò)者為(wèi)王立贤研究员和赵福平副研究员。该研究得到國(guó)家自然科(kē)學(xué)基金项目（No.31572357）和生猪现代产(chǎn)业技(jì )术體(tǐ)系（CARS-35）支持。

　　原文(wén)链接：https://jasbsci.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40104-020-00447-0

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